bekend als een van de beste universiteit van Azië
Ongetwijfeld de beste universiteit in de Filippijnen volgens velen bron
De Ateneo de Manila University begon in 1859 toen de Spaanse jezuïeten vestigde de Escuela Municipal de Manila, een publiek in Intramuros vastgesteld voor de stad Manilla basisschool. Echter, de educatieve traditie van de Ateneo omarmt de veel oudere geschiedenis van de jezuïeten als een pedagogisch orde in de Filippijnen. De eerste Spaanse jezuïeten aangekomen in het land in 1581.
Terwijl vooral missionarissen, waren ze ook beheerders van de verhouding studiorum, het systeem van de jezuïet onderwijs geformuleerd over 1559. In 1590, richtten zij een van de eerste scholen in de Filippijnen, het Colegio de Manila (ook bekend als de Colegio Seminario de San Ignacio) onder leiding van Antonio Sedeño, SJ De school officieel geopend in 1595. In 1621, Paus Gregorius XV, door de aartsbisschop van Manilla, machtigde de San Ignacio om graden te verlenen in de theologie en de kunsten.
Twee jaar later, koning Filips IV van Spanje bevestigde deze machtiging, waardoor de school een koninklijke en een pauselijke universiteit, de eerste universiteit in de Filippijnen en in Azië. Echter, door het midden van de 18e eeuw, de katholieke koloniale machten, met name Frankrijk, Portugal en Spanje, waren vijandig tegenover de Sociëteit van Jezus geworden. De koloniale machten uiteindelijk verdreven de Society, vaak heel brutaal, uit hun rijken. De jezuïeten moest de San Ignacio afstaan aan Spaanse civiele autoriteiten in 1768, op hun gewelddadige verdrijving van alle Spaanse gebieden.
Tot slot, onder druk van de katholieke royalty, paus Clemens XIV formeel verklaarde de ontbinding van de Sociëteit van Jezus in 1773. Paus Pius VII hersteld van de Society in 1814, na bijna zeven decennia van vervolging en meer dan vier decennia van de formele onderdrukking. Toch zou de jezuïeten niet terugkeren naar de Filippijnen tot 1859, bijna een eeuw na hun uitzetting. Gemachtigd door een koninklijk besluit van 1852, tien Spaanse jezuïeten aangekomen in Manila op 14 april 1859. Deze jezuïet missie werd vooral gestuurd voor zendingswerk in Mindanao en Jolo.
Ondanks bijna een eeuw uit de buurt van de Filipijnen, de jezuïeten 'reputatie als opvoeders bleven verschanst in de hoofden van Manilla leiders. Op 5 augustus, de ayuntamiento of gemeenteraad verzocht de gouverneur-generaal een jezuïetencollege met publiek geld gefinancierd.
Als een universiteit, de A