Uiteindelijk, in 1997, de groep herenigd en publiceerde nog een andere opname, 'Generation Swine'. De schijf niet goed in de handel te doen, wat resulteerde in hen het verlaten van hun platenlabel, Elektra.In '98, na hun contract met Elektra was verstreken, de groep bevonden zich in een unieke positie. Zij zijn een van de weinige groepen om de volledige controle, zowel over hun catalogus van meesters en uitgeverijen hebben. Met deze pas ontdekte vermogen, de groep opnieuw uitgebracht al hun albums en inclusief vele demo's en voorheen onuitgebrachte tunes.
In 1999, Tommy Lee vertrok de band om zijn eigen solo-carrière voort te zetten en verdere conflicten met Neil voorkomen. Hij werd vervangen en de band bleef tour en sloeg de studio, maar viel kort van echt succes. Sixx ook ging zijn eigen richting en speelde voor de bands "58" en "Brides Of Destruction '. Het duurde vijf jaar, maar de band uiteindelijk toch weer bij elkaar te komen en kreeg bezig met het opnemen van een nieuwe compilatie album genaamd 'Red White & Cre'.
Ze ook gingen op een paar circuits, met inbegrip van hun '05 tour, 'Carnival of Sins' en '06 'Route van All Evil' tour dat ze co-headliner met Aerosmith.Just vorige maand, Mtley Cre bracht hun laatste album 'Saints of Los Angeles'. Critici zeggen dat het album is een van de beste werk dat ze ooit hebben opgenomen! Het is een ernstige flash-back van de band eerder stijl en een welkome een op dat. Het lijkt deze slechte jongen rockers gaan nog steeds naar hun oorspronkelijke missie om het publiek zo hard als ze kunnen schudden.