Het grondgebied werd officieel benoemd Carolina in 1663 toen de Koning Charles II van Engeland verleende het grondgebied van een groep van eigenaren gewoon bekend als de Acht Heer eigenaars. De naam Hilton Head komt uit het Engels kapitein William Hilton, die er de naam voor zichzelf in 1663. Een paar jaar later, in 1698, Engels nederzettingen begon in het gebied dat bekend staat als de Lage Land. In 1717, kolonel John Barnwell werd de eerste permanente kolonist op het eiland na toekenning duizend hectaren door de Heer Proprietors.
During de Revolutionaire Oorlog, Hilton Head eiland werd bezet door de kolonisten, terwijl nabijgelegen Dafuskie eiland werd bezet de Tories, of Britse sympathisanten. Tijdens het conflict, Britse soldaten verbrand plantages op het eiland en captured slaves, ze te verkopen aan West-Indië. Na de oorlog, het eiland hersteld en werd een bloeiende landbouw hub, de uitvoer van rijst, indigo en katoen. Op het moment van de Civil War, South Carolina was één van de meest welvarende landen, en vele miljonairs leefden op Hilton Head Island.
South Carolina was de eerste staat af te scheiden van de Unie in 1860, en in oktober van 1861, had 77 schepen Unie uit Virginia zeilde naar Port Royal, Het eiland werd, tegen het einde van de oorlog, het hoofdkwartier weer de Zuid-Atlantische blokkeren Squadron , evenals een transfer voor krijgsgevangenen en voor gewonde soldaten. De eerste zwarte troepen voor de Unie is afkomstig van het eiland, de voormalige slaven die, na de oorlog, gebruikt het geld dat ze verdiend als soldaten om land te kopen en zich te vestigen op Hilton Head.
De grootste zeeslag van de Burgeroorlog, de Slag van Port Royal, werd ook gevochten op de eilanden shores.Today, het eiland is een immens populaire toeristische bestemming, waarin stukjes van Hilton Heads rijke historie in de moderne dag musea, monumenten en historische sites. Terwijl u op vakantie op het eiland, moet u een aantal van deze plaatsen te zien voor jezelf om meer te ontdekken over de unieke geschied