Environmentalists krijgen hebben ook geklaagd over het hek, omdat ze zeggen dat het brengt al bedreigde soorten, zoals twee soorten wilde katten - de ocelot en de jaguarundi - - in nog meer met uitsterven bedreigd. Ze zeggen dat het hek hen zou verhinderen zwemmen in de Rio Grande om te paren. 'Onwillig te overleggen met de lokale gemeenschappen of te lang bestaande wetten te volgen, secretaris Chertoff koos om stakeholders te omzeilen en te duwen door deze impopulaire project op April Fool's Day, "Sierra Club directeur Carl Pope zei in een verklaring.
"We denken niet dat de vernietiging van de Borderlands regio is een lachertje." Chertoff heeft gezegd dat het hek is goed voor het milieu, omdat immigranten degraderen het land met afval en menselijke uitwerpselen als ze stiekem illegaal in het land.