Elk van de beschikbare behandelingen zijn superieur aan andere en geen enkele behandeling is ideaal voor alle patiënten of wratten en geen definitief bewijs suggereert hetzelfde. Het gebruik van lokaal ontwikkeld en gecontroleerd behandelingsalgoritmen is geassocieerd met een verbeterde klinische resultaten moet worden gestimuleerd. Vanwege onzekerheid over het effect van behandeling op toekomstige transmissie van HPV en de mogelijkheid van spontane resolutie, een aanvaardbaar alternatief voor sommige personen bij de behandeling afzien en wacht op spontane resolutie.
Genitale wratten vaak in groepen en kunnen accumuleren in grote massa's op genitale weefsels. Ze verschijnen vaak na de behandeling. Afhankelijk van factoren zoals de grootte en ligging zijn er een aantal behandelingen van genitale wratten. Kleine wratten kunnen worden verwijderd door bevriezing (vloeibare stikstof) of een branderig gevoel (electrodessication) .Om grote wratten die niet hebben gereageerd op andere behandelingen chirurgie is soms nodig te verwijderen.
Chirurgie om genitale wratten verwijderen kan op verschillende manieren worden ingevuld (inclusief via laser) door een deskundige zorgverlener. Patiënten met veel of grote wratten kan hebben om een operatie als een optie te kiezen. Chirurgie is ook de enige behandeling die het algemeen kan verwijderen van een wrat met slechts één bezoek.
Na een behandeling heeft ondergaan van genitale wratten, ze moet men regelmatig te onderzoeken om te controleren op nieuwe wratten. Tirus waardoor de wratten (HPV) gaat niet weg door de behandeling van genitale wratten.
Als wratten terugkomen, zijn ze meestal doen binnen drie tot zes maanden van de behandeling. Dit probleem komt vaker voor bij vrouwen met een verzwakt immuunsysteem. Het vermijden van mensen die genitale wratten of HPV kan het risico besmet te raken met HPV verminderen.