. Merton adviseerde hem om zijn chef wensen te volgen, maar om te volharden in zijn bredere missie. Daniel uiteindelijk gehoorzaamde zijn superieur.
Zijn broer, Philip, als Josephite, bleef Jim Crow te confronteren in het Zuiden en raakte betrokken bij de distributie van voedsel en kleding. Philip bleef activist en confronterend betrokkenheid, zowel in de burgerrechtenbeweging en als een uitgesproken criticus in de jaren 1960 resulteerde in zijn gedwongen transfer van zijn gemeenschap. Hij werd ook verteld om de publieke stilte over de oorlog in Vietnam te behouden. Hij deed deze stilte niet lang behouden. Hij bleef parallellen tussen oorlog en racisme te trekken.
Hij sloot zich met SANE en CORE aan tegen de Amerikaanse militaire interventie in Zuidoost-Azië uit te spreken
Het was de Golf van Tonkin affaire die het keerpunt in de Amerikaanse betrokkenheid in Vietnam was.; President Lyndon Johnson gebruikte deze valse incident aan de voortzetting en versnelling van de oorlog te rechtvaardigen. Deze nieuwe realiteit gestold de broers Berrigan 'verzet tegen het conflict.
Daarnaast is de houding van de Afro-Amerikanen in de richting van hun voortdurende onderdrukking verschoven naar grotere strijdbaarheid zoals blijkt uit de stijging van de invloed van Malcolm X. De Watts rellen van 1965 verder toegevoegd aan de nationale onzekerheid. Katholieke Arbeiders, die de progressieve vleugel van de katholieke kerk gesticht in 1933 door Dorothy Day en Peter Maurin vertegenwoordigde, werd meer betrokken bij de anti-oorlogsbeweging activiteiten met een aantal van hun leden zelf tot leven in protest branden net als hun Boeddhistische tegenhangers in Vietnam.
Een daarvan was Roger LaPorte. Daniel wist LaPorte; als gevolg daarvan, bisschop kardinaal Spellman geprobeerd te hebben Daniel verdreven uit het aartsbisdom New York. Als compromis werd hij naar Chili. Daar heeft hij een aantal belangrijke soul searching.
De volgende zijn enkele van de bekende betrokkenheid van de Berrigans in de anti-oorlog.
Op oktober 27,1967, de Baltimore Four (Philip Berrigan, kunstenaar Tom Lewis, dichter, leraar en schrijver David Eberhardt en
(5) Staat Wide Questions