van Lyme moeilijk te behandelen en de patiënt extra zorg nodig dan alleen orale antibiotics.To bestrijden ziekte van Lyme en de symptomen, de meest populaire medicijnen zijn antibiotica die oraal kunnen worden toegediend. Antibiotica zoals doxycycline zijn bekend effectief te zijn, vooral als de ziekte in een vroeg stadium. Amoxicilline wordt ook veel gebruikt voor de bestrijding ziekte van Lyme en is bekend bij de Borreliabacterie verstoren door bewonen de celvermeerdering.
Een ander geneesmiddel is ceftriaxone, dat intraveneus wordt toegediend en kan de bacteriën in het centrale zenuwstelsel verstoren. Medische preparaten omvatten ibuprofen, die wordt gebruikt om gewrichts- en spierpijn die een direct gevolg van de ziekte van Lyme zijn verlichten.
