Late complicaties na chirurgische reparatie onder endocarditis (indien een resterende shunt blijft na de operatie), chirurgisch geïnduceerde aorta of pulmonaire insufficiëntie en tricuspidalisklep regurgitatie (als het septum bijsluiter is gemanipuleerd tijdens de VSD reparatie). Aritmieën en geleidingsstoornissen kunnen zien. Rechts-bundeltakblok optreedt in 30% tot 60% van de patiënten na chirurgische sluiting, de eerste graad AV-blok wordt gezien in 10%, en het complete hart blok in 1% tot 3% over de lange-termijn follow-up.
Patiënten kunnen LV dysfunctie hebben met late herstel van het gebrek of met significante aortaklepinsufficiëntie. Patiënten kunnen persisterende pulmonale hypertensie na operatie of kan progressieve pulmonale hypertensie ondanks succesvolle afsluiting van de shunt te ontwikkelen. Er is een verhoogd risico op plotselinge hartdood FO na sluiting waargenomen bij 2% van de patiënten. De oorzaak voor de plotselinge dood niet defined.
In algemene geweest, patiënten die vroeg reparatie zonder resterende shunt, het bewijs van pulmonale hypertensie, hartritmestoornissen, of geleiding blok niet op lange termijn follow-up nodig. Later reparatie van VSD's gaat gepaard met een risico van pulmonale hypertensie en LV dysfunctie, het maken van lange-termijn follow-up van deze patiënten verplicht.